Как правильно Ben brushes/is brushing his teeth every morning ?
Видел ответы на данное задание, но мне нужно понять почему так и попытаться объяснить ребёнку.

Первый вариант правильный, так как это относится к ежедневной привычке, которую делаем каждый день (указывая при этом every day). Ben is brushing teeth right now - можно так сказать, если он моет зубы в данный момент.