Почему выражение:
Почему ты не хочешь?
записывают:
Why dont you want?
а не
why you dont want
Это можно писать как хочешь,те в любом порядке?

Это не выражение, а вопросительное предложение. Так называемое вопросительно-отрицательное. То есть строится вопросительное предложение по всем правилам, а не "как хочешь", и не "в любом порядке"!( вопросительное слово(если вопрос его подразумевает), вспомогательный глагол.....), и используется отрицательная частица "not", которая ставится после вспомогательного( как в данном конкретном случае) или модального глагола(возможен и такой вариант) перед подлежащим и передавать эта частица в специальных вопросах будет только отрицание( в общих-оттенок удивления).В Вашем случае задан специальный вопрос.Why(вопросительное слово) don't(вспомогательный глагол+отрицательная частица not) you(подлежащее) want?