Нельзя отрицать, что помимо БЦБК, существует еще ряд угроз уникальному озеру, однако, стоит отметить, что комбинат все время был и остается крупнейшим загрязнителем озера.а) Сбросы балластных вод с судов и загрязнение озера нефтепродуктами.б) Неконтролируемый массовый туризм.в) Загрязнение, поступающее со стоком р. Селенга (см. доклады МПР РФ «О состоянии озера Байкал и мерах по его сохранению»).г) Атмосферный перенос загрязнений от Шелехов-Ангарского промышленного узла и г. Иркутск.д) Загрязнение комунально-бытовыми стоками населенных пунктов, расположенных на берегах Байкала.е) Браконьерство.ж) Вырубка лесов в водосборном бассейне озера и лесные пожары.