Пагін- це переважно надземний вегетативний орган вищих рослин,скадається із стебля та розміщених на ньому листків та бруньок.Всі частини пагона пов'язані між собою єдиною провідною системою.Корінь-це в більшості випадків підземний вегетативний,орган вищих рослин.Він здатний до необмеженого росту в довжину.Пагін розвивається з бруньки, корінь-з зародкового корінця.Пагін виконує багато функцій:опорну,фотосинтез,транспортну,запасаючу також бере участь у вегетативному розмноженні.Риси відмінності:-на стебелі є листя і клітини,що містять хлоропласти,в корені відсутні клітини з хлоропластами тому відсутня здатність до фотосинтезу.-на стеблі утворюються квітки,а на корені ні-корень переважно підземний вегетативний орган,а пагон надземний.