у одних бактерий обмен веществ происходит с участием а у других без него

Это кислород.

Бактерии, нуждающиеся в свободном кислороде, называются аэробными, а те, которые могут без него обойтись, – анаэробными. Факультативные анаэробные бактерии могут жить как в кислородсодержащей среде, так и в бескислородной , а для облигатных анаэробных бактерий свободный кислород ядовит.

У одних бактерий обмен веществ происходит с участием кислорода их называют аэробные 

а другие бактерии которые обходятся бе кислорода называют анаэробные