антибиотик пеницилин 60 лет назад был эффективен для борьбы с микробами. В наши дни даже очень большие дозы пеницилина не убивают бактерии. Как объяснить этот факт?

Это можно объяснить тем, что все организмы со временем привыкают к изменениям. То есть у бактерий выработался иммунитет и поэтому на них не действует этот препарат.