Чому слід охороняти не окремі рідкісні або зникаючи види, а цілісні - екосистеми, до складу яких вони входять?
Речь идет о растениях.

я спрашиваю не о взаимодействии между системами, а почему нужно охранять одну экосистему целиком, а не отдельные виды растений в ней

Потому что все системы связаны и изменения одной экосистемы влечёт за собой изменения других.