Моторные функции рыб, связанные с схватыванием пищи и плаванием, а также общую регуляцию и координацию движений, регулирует мозжечок, который связан нервными волокнами с спинным, средним и продолговатым мозгом. Он расположен в задней части головного мозга рыб и прикрывает частично сверху продолговатый мозг. Выделяют тело мозжечка и ушки мозжечка (аурикулы), состоящие из дух боковых отделов. Рыбы с высокой активностью движений имеют увеличенный, который достигает до 15% всего мозга.