Автотрофных бактерии имеют большое значение для жизни на планете Земля. Так как с помощь них происходит синтез полезных органических веществ, а также автотрофные бактерии являются источником питания для некоторых живых существ. Кроме того, некоторые бактерии данного типа могут быть использованы в космическом пространстве. Они используются на космических кораблях в качестве синтезаторов кислорода. Однако данные бактерии распространены в очень малом количестве, по сравнению с другими живыми существами.