Главной причиной нарушения процесса сцепления генов может стать кроссинговер. Перекрест хромосом в профазе 1 мейотического деления получил название кроссинговер. Если в хромосоме гены расположены далеко друг от друга, то вероятность образования перекреста между ними высока и процент образования гамет с перекомбинированными генами велик, а значит в потомстве образуется больше особей с признаками, отличными от родителей. 1% кроссинговера равен расстоянию между генами, лежащими в одной хромосоме. Иначе эту величину называют ещё одна морганида.