Пресмыкающихся в целом более высокоразвитые, чем земноводные, и это отображается и на их строении. Так, из-за жизни вне водоёмов их кожа стала более плотной и выносливой, покрылась чешуей. Разделы скелета более ощутимы, кости сильнее. В связи с большим и разнообразным ареалом обитания и еды, у рептилий система пищеварения тоже более сложная и развитая. Отличаются и кровеносная система. Легкие по структуре и форме похожи, однако земноводные могут дышать кожей, а рептилии только ноздрями.