Между клубеньковыми бактериями на корнях бобовых и самими растениями устанавливаются тесные симбиотические отношения. В результате симбиоза на корнях растений образуются клубеньки, внутренняя часть которых состоит из бактериальной (бактероидной) ткани, которая обладает способностью удерживать азот. Так как клубеньки на корнях бобовых сохраняются недолго, особенно у однолетних растений, это дало возможность использовать заражённые растения для обогащения почвы азотом, который освобождается из разрушенных тканей клубеньков.