1) Отличается один из важнейших органоидов - хлоропласт. У водорослей хлоропласты могут варьировать по количеству, размеру, и форме в самых широких пределах, в то время как у подавляющего большинства многоклеточных растений в клетке сравнительно много не очень крупных хлоропластов. Очень важно - у многоклеточных растений никогда нет пиреноида в хлоропластах, а у водорослей обычно есть. 2) В составе клеточных стенок водорослей и высших растений разные вещества. 3) Перечень запасных углеводов одноклеточных водорослей просто огромен: хризоламинарин, маннан, багрянковый крахмал и т.д. Большинство многоклеточных растений ограничиваются крахмалом или веществами, значительно на него похожими.