Дихальна система плазунів складається з легенів, дихальних шляхів, трахеї і бронхів. Плазуни не мають діафрагми, тому подих відбувається за рахунок руху м'язів стінок грудної порожнини. Деякі види плазунів, такі як змії, можуть мати лише одну функціональну легеню. Плазуни також можуть мати спеціалізовані дихальні органи, такі як легеневі мішки у крокодилів, що дозволяють збільшити обсяг подиху і зберегти повітря для довшого перебування під водою.