Цитата из учебника биологии: "Совокупность всех веществ, составляющих содержимое клетки, называется протопластом. К первичным производным протопласта относится клеточная оболочка и вакуоль."

Почему вакуоль не входит в протопласт, ведь это тоже органоид клетки?

Когда запас воды в вокуоли закончится она проподёт, и через некоторое время вода опять появится и вакуоль тоже появится. Вывод: вокуоль непостоянна поэтому она не органоид.