Корень — это главная значимая часть слова. Именно корень выражает основное значение слова и общее лексическое значение всех однокоренных слов. В словах \"хочет\" и \"хотим\" корень соответственно хоч- и хот-. Корень в этих словах один, просто в нем происходит чередование согласных т-ч.