В слове шишки 2 орфограммы, которые нужно знать.1-я: «Парные звонкие и глухие согласные»,Ж-Ш,Чтобы проверить написание надо подобрать однокоренное слово или изменить слово - шишок.2-я: «Правописание гласной после шипящих». ЖИ, ШИ пиши с буквой И! После Ж, Ш никогда не пишется Ы, даже если слышится.