Корнем в слове мусор является всё слово целиком, приставки нет, суффиксов нет, а окончание нулевое. Если рассматривать образуемые слова, то часть слова - корень *мусор* нигде не меняется - мусорить, в мусоре, мусоропровод, мусорщик, мусоровоз, замусоренный и так далее.