Слова переколпаковать и перевыколпаковать родственные или это просто изменение формы?

Форма одного и того же слова имеет разные окончания, но одну и ту же основу: президентский, президентская, президентские. Однокоренные же слова имеют разные основу и, следовательно, отличаются лексическим значением. В основу слова входят: приставка, корень, суффикс.

Слова  переколпаковать и перевыколпаковать являются родственными, так как они имеют разные основы:  переколпакова-  и перевыколпакова-. Во втором слове есть приставка вы-, которой нет в первом слове.