Что вписывать вместо точек They.....pupils in 1990

В английском языке не может быть предложения без сказуемого. Если нет смыслового глагола, используется глагол-связка to be в соответствующем времени. В данном предложении действие относится к прошлому, на это указывает обстоятельство времени in 1990. А поскольку подлежащее выражено местоимением множественного числа they, глагол to be необходимо употребить в форме were:

They were pupils in 1990. - В 1990 году они были учениками.