1)Mary(clean) her room every Saturday. .2)....dad often(cook)breakfast for you? Поставить в Present Simple

1) Mary(clean) her room every Saturday. — Mary cleans her room every Saturday. 

2)....dad often(cook)breakfast for you? — Does dad often cook breakfast for you? 

Present Simple обозначает действия, которые происходят в настоящее время, но не привязаны именно к моменту речи.

 Present Simple почти всегда совпадает со своей начальной, то есть указанной в словаре, формой без частицы to. Лишь в 3-ем лице единственного числа к ней нужно прибавить окончание -s:

I clean

You clean

He cleans

вопросительное предложение, перед подлежащим нужно поставить вспомогательный глагол. Время Present Simple используется без него, поэтому в этом случае добавляется вспомогательный глагол do (или does в 3 л. ед. ч.):

Do I clean?

Does he clean?

В отрицательных предложениях тоже используется вспомогательный глагол do/does, но не перед подлежащим, а перед глаголом. После него прибавляется отрицательная частица not

I do not clean

He does not lean