В предложении What (has или have) happened to the boy? - I don't know.

В данном случае необходимо вставить в предложение на английском вариант ответа «has». Все предложение будет выглядеть так - What has happened to the boy? - I don’t know.

В переводе на русский язык это будет звучать так - Что случилось с мальчиком? - Я не знаю.