Какая ошибка в предложении They had a quarrel but now they’ve made it well.

Нужно убрать слово now (сейчас). Now является указателем Present Progressive Tense (настоящего длительного времени). В то время как в Present Perfect Tense (настоящем совершенном времени) говорится о совершенных действиях без точного указания времени.