Fred said:" I have lnvented a new computer program " из прямой в уосвенную

Предложение Fred said:\" I have invented a new computer program.\" преобразовывается в косвенную речь таким образом : 

Fred said that he had invented a new computer program.

В данном случае, согласно правилам, Present Perfect преобразовывается в Past Perfect, кавычки убираются и ставится союз that.