В верховьях сжимают реку жёлто-красные сосновые леса, наполняя воздух запахом сосны. Почемму перед "наполняя воздух запахом

Наполняя - деепричастие с зависимыми от него словами. По правилам русского языка деепричастия с зависимыми словами являются деепричастным оборотом и всегда выделяются с двух сторон запятыми. 

Наполняя (что?) - воздух (наполняя воздух чем?) - запахом, (запахом чего?) - сосны.