Ни кондукторшу, ни пассажиров не поразила самая суть дела - не то, что кот лезет в трамвай, в чём было бы ещё полбеды,

Между этими двумя предложениями возможно тире потому что во втором есть вывод, объяснение и оно не соединяется союзом. Тире возможно, потому что оно - заменитель союза.