почему с помощью микроскопа Нельзя увидеть атом

Увидеть с помощью обычного света нельзя. Потому что размеры атома  меньше длины волны света. Так что увидеть  атомы можно только с помощью специальных приборов:  туннельный микроскоп или атомно-силовой микроскоп.

потому что длинна волны сильно больше размера атома, свет просто огибает отдельные атомы. но на электронных микроскопах рассмтреть таки можно. за счет резонансного рентгеновского излучения самого рассматриваемого матриала.