Как изменится движение пули, если на ее пути встретится доска, которую она пробивает? Сохранится ли при этом кинетическая энергия пули? Не противоречит ли закону сохранения энергии изменение кинетической энергии пули при пробивании доски?

Скорость пули значительно упадет  Кинетическая энергия не сохранится. Никакому закону это не противоречит 

Скорость пули станет меньше, т.к при доска имеет свою отталкивающую силу. Никаким законом не противоречит.