Молекула делится на атомы. Атом состоит из ядра и электронов, а ядро - из протонов и нейтронов. Почему нельзя сказать

Если ответить, что вещества состоят из нейтронов, протонов и электронов, то это будет похоже на то, что эти частицы в веществе распределены равномерно. На самом деле это совсем не так. Во-первых в наших условиях нейтроны, протоны и электроны в основном объединены в атомы и (или) молекулы. Во-вторых, при таком ответе мы ничего не сможем сказать о химических и физических свойствах веществ, которые определяются именно строением атомов и молекул. Если число различных атомов сравнительно невелико (несколько сотен вместе с изотопами), то возможное число различных молекул невообразимо велико.