как узнать,ядро какого атома приобретает большую кинетическую энергию после столкновения.

Использовать специальные приборы, такие как камера Вильсона, пузырьковая камера, или методом толстослойных эмульсий. По треку частицы можно определить многое, в том числе и ее кинетическую энергию.