Балтийской эту систему называют потому, что для измерения уровня моря используют так называемый футшток (рейка с делениями для измерения уровня воды в водоеме), расположенный в Кронштадте на Балтийском море. Проводить регулярные измерения уровня Балтийского моря начали еще при Петре I. В России и некоторых других странах эта система применяется и в наше время.