Основная причина - на этой территории не было сильных государств способных оказать в XVI-XVIII веках сильное сопротивление Московскому царству и Российской империи. Например, Сибирское ханство разгромил в 1582 году атаман Ермак с отрядом из 540 казаков. После его смерти в 1585 туда приходили отряды по 200-300 стрельцов. Территория Сибири и Дальнего востока была малонаселенной, а население в основном занималось охотой, ловлей рыбы и собирательством, следовательно, его просто заставили платить дань, а земледельцам-переселенцами эти племена особо не мешали.