Доля морей океана равна 15%. Самые крупные: Аравийское (3,8 млн.км2), Андаманское (605 тыс.км2), Красное (438 тыс.км2) расположены в северной части океана, на юге Арафурское море (1 млн.км2) омывает берега Австралии и Новой Гвинеи. Заливы составляют 9,5% пространства водоема: Большой Австралийский (1,3 млн.км2), Бенгальский (2,2 млн.км2), Персидский (238 тыс.км2) — крупнейшие в Индийском океане.