Более основной является вода. Растворите в воде любую сильную кислоту - получите катион гидроксония H3O(+). Основные свойства метана проявляются только в реакции с суперкислотами с образованием катиона метония CH5(+).
В качестве объяснения можно предложить следующее: у атома кислорода в воде есть неподеленные электронные пары, поэтому возможна донорно-акцепторная связь с H(+). В метане атом углерода не имеет неподеленных электронных пар, поэтому не обладает основностью.