определить, произошёл ли при Алексее Михайловиче переход от сословно-представительной монархии к самодержавию.

Нет, после него, при Софье состоялось собрание, которое принято считать последним Земским собором, а в принципе, Алексей - полноценный абсолютный монарх, ни от кого не зависимый.