Как вы понимаете слова историка ключевского о лжедмитрии и он был только испечен в польской печке А заквашен в Москве

Всё просто, Лжедмитрий в Россию пришёл с польских земель, т.е. метафора - Лжедмитрий как свежеиспечённый хлеб. Зн. "испечён" в ВКЛ,  а в Москве "заквашен".