Почему именно в Новгороде начал своё правление Рюрик?

Потому что на то время там находился трон и Здание Правления.

Его пригласил Гостосмысл именно в Новгород, т.к. там народ поставил трон, где Рюрик правил. Братья же его, Синеус и Трувор, правили в Белоозере и Киеве(вроде).