В измене какаому государю обвинялся Ляпунов?

Захарий Петрович Ляпунов постриг в монахи царя Василия Шуйского, тем самым отстранив его от престола.

Сделал он это во время появления самозванца Лжедмитрия II. 

В Москве Ляпунов выступил организатором народных волнений, поставил перед Василием Шуйским ультиматум об отречении от престола. 

Позже Ляпунов переметнулся в польский лагерь, предав своих коллег по посольству.

Ляпунов подавал челобитные о пожаловании ему земель как Василию Шуйскому, так и Сигизмунду (который был королем Польши).