Органы центрального управления, созданные в России в ХVI веке, назывались ….

Они назывались приказы. Они могли быть как отраслевыми, так и территориальными, например. Сибирский приказ управлял регионом, а Ямской приказ - почтовыми и транспортными перевозками.

В XVII веке приказов стало больше. Например, лифляндский и смоленский управляли территориями на западе, а рейтарский - новым типом кавалерии.