В XVI столітті, Православна церква зазнала значних випробувань через владу Османської імперії, яка контролювала значну частину православного світу. Церква була піддана високому податковому тягарю і обмеженим правам. У першій половині XVII століття ситуація не суттєво поліпшилася. Церковні влади продовжували боротьбу за збереження віри та традицій.У той час, Католицька церква переживала Реформацію, що спричинило дисидентські рухи та розколи в Європі. Католицька церква активно протистояла поширенню протестантизму і вела Контрреформацію, спрямовану на відновлення ідеологічної єдності в Європі. У цей період відбувалася інквізиція, яка мала на меті виявлення і покарання єретиків.Щодо інших конфесій, у XVI та XVII століттях багато релігійних груп, таких як протестанти, євреї та інші меншини, стикалися з переслідуванням та обмеженнями в багатьох країнах Європи. Вони шукали притулок у більш ліберальних країнах або колоніях.Узагальнюючи, в цей період Православна церква відчувала тиск з боку Османської імперії, Католицька церква боролася з внутрішніми і зовнішніми загрозами, а інші конфесії стикалися з різними ступенями переслідувань та дискримінації в Європі.