Почему Толстой отдал Марью Николаю?

Потому что это его идеал семейного счастья: преданные друг другу супруги, умная жена, которая несет в семью духовность, наставляет и направляет детей и мужа. Кроме того, прототипом этой семьи были родители самого Льва Николаевича.