Данное предложение является сложносочиненным. В нем две грамматические основы. В первом простом предложении \"Сидит он раз в яме на корточках, думает об вольном житье\" грамматическая основа-двусоставная, то есть состоит из подлежащего и сказуемого. Подлежащее-он(местоимение). Сказуемые-сидит, думает(однородные сказуемые, оба относятся к подлежащему \"он\"). Во втором простом предложении \"скучно ему\" грамматическая основа-односоставная. Она представлена сказуемым-скучно(наречие). Подлежащего нет. К подлежащему нельзя отнести местоимение \"ему\", так как оно стоит в творительном падеже.