В школе 17 города N каждый учебный день начинается с молитвы. Может ли эта школа находится в России? Какую из основ конституционного строя это нарушает? При каких условиях ученики школ могут совершать в них религиозные обряды?

Эта школа может находится в России, но она не является государственной, потому что это бы противоречило ст.14 Конституции РФ, в котором Россия провозглашена светским государством. Ученики могут совершать религиозные обряды в специализированном негосударственном учебном заведении - например, в семинарии, церковной школе и т.д.