500 млн лет назад на Земле не было ни животных, ни растений,ни человека. как вы думаете, была ли тогда почва?

Да, она скорее всего была, но она не была плодотворной. 

Я думаю, почва была. Так как жизнь растений без почвы не начнется, да и животные ведь должны по чему то ходить.