Почему некоторые ученые не считают местоимения самостоятельной частью речи?

Потому что по своим морфологическим признакам местоимения соотносятся с существительными, прилагательными и числительными, отвечают на их вопросы, выполняют такую же синтаксическую роль в предложении, они полностью заменяют эти части речи и их подразделяют на местоимения-существительные,местоимения-прилагательные, местоимения-числительные