...тогда и воздух, которым мы дышим, будет целебен и вкусен...
Почему перед "будет" ставится запятая?

это продолжение грамматической основы воздух ... будет, то есть в этом предложении их 2 "воздух будет" и "мы дышим", где "мы дышим" отделяет подлежащее- "воздух", от сказуемого- "будем"