Ничей хронометр лежал на столе капитанского мостика,когда я вернулся хронометра уже не было.
Правильно ли составлено предложение?

Просто задание было составить сложносочинённое предложение с словосочетанием ничей хрономет

Можно сказать почти и да, но минус в том где когда можно перед поставить Но и получится так: Но когда я вернулся хронометра  уже не было, или не стало.