какой корень в слове днём?

Правильно!

Ем-окончание,п.ч. изменяется!Например,дня,дню!

корень в слове днём- дн, ём-суффикс

Корень в слове днём - дн.Чтобы найти корень, нужно подобрать однокоренные слова, например: дневной. В этом слове тоже есть корень дн, значит и в слове днём будет корень - дн.Удачи!