Разберите слово по составу: самостоятельную, самостоятельный

.В Морфемно-орфографическом словаре тихонова дан такой разбор по морфемам:

самостоятельный

самостоятельн - корень

-ый  окончание

основа самостоятельн-

В форме ж.р. "самостоятельную" -    корень самостоятельн-, а окончани -ую.

(когда ищем корень, подбираем однокоренные слова: самостоятельность, самостоятельно - то есть нет слов с меньшим корнем.

К слову "сам" это слово не имеет отношения)