Братья остались наедине и сначала только посматривали друг на друга. в этом предложении наедине и сначала пишутся слитно
Продавец так (же) несет ответственность перед покупателем за повреждение или поломку груза (в)следствие ненадлежащей упаковки, как и покупатель перед продавцом за своевременную оплату товара. также можно заменить тоже, поэтому слитно? вследствие в данном случае пишется слитно?

Правильно. также можно заменить  тоже и вследствие можно заменить - в результате( ВСЛЕДСТВИЕ ПИШЕТСЯ СЛИТНО)

1. Наедине и сначала - наречия, пишутся слитно2. так же - пишется раздельно, так ка есть союз КАК: так же..., как и  (так - наречие, же -частица)вследствие - предлог причины (= из-за)  пишется слитно